Da bi ugotovili njegovo uporabnost pri odkrivanju HCC, smo ocenili test HCCScreen pri posameznikih, ki imajo znano diagnozo HCC ali so bili izključeni (ne-HCC). Prišli smo 65 primerov HCC in 70 primerov, ki niso HCC, od AFP/ZDA pozitivnih/osumljenih posameznikov. Ta HCC-pozitiven ali HCC-negativni status je temeljil na dinamičnem slikanju s CT/MRI in histološki potrditvi.

Teh 135 primerov je bilo uporabljenih kot kohorta za usposabljanje, rezultate HCCScreen pa so primerjali s klinično diagnozo. Za izgradnjo klasifikatorja, ki v test vključuje različne vrste biomarkerjev, smo najprej zrušili različne vrste mutacij cfDNA v oceno regije, ki vas zanima (ROI) za vsak gen ali lokus (glej metode). Rezultat ROI je bila tehtana vsota škodljivih učinkov in frekvence za vsako točkovno mutacijo znotraj ROI.